Clinical and epidemiological features of tuberculosis isolated from critically ill patients.

Human tuberculosis is still a major world health concern. In Uruguay, contrary to the world trend, an increase in cases has been observed since 2006. Although the incidence of MDR-resistant strains is low and no cases of XDR-TB were registered, an increase in the number of patients with severe tuberculosis requiring critical care admission was observed. As a first aim, we performed the analysis of the genetic structure of strains isolated from patients with severe tuberculosis admitted to an intensive care unit. We compared these results with those corresponding to the general population observing a statistically significant increase in the Haarlem genotypes among ICU patients (53.3% vs 34.7%; p<0.05). In addition, we investigated the association of clinical outcomes with the genotype observing a major incidence of hepatic dysfunctions among patients infected with the Haarlem strain (p<0.05). The cohort presented is one of the largest studied series of critically ill patients with tuberculosis.

Species Distribution and Isolation Frequency of Nontuberculous Mycobacteria, Uruguay.

Nontuberculous mycobacteria (NTM) increasingly are recognized as opportunistic pathogens of humans. NTM species distribution is well documented in Europe and North America, but data from other regions are scarce. We assessed NTM isolation frequency and species distribution in Uruguay during 2006-2018.

Tuberculosis cutánea a forma de lupus vulgar causada por vacuna de bacilo Calmette-Guérin. A propósito de un caso pediátrico / Lupus vulgaris as a form of cutaneous TB caused by the Bacille Calmette-Guérin vaccine. A pediatric case / Tuberculose cutânea sob forma de lúpus vulgar causada pela vacina de bacilo Calmette- Guérin. A propósito de um caso pediátrico

La tuberculosis cutánea es una enfermedad infecciosa crónica y poco frecuente ocasionada por Mycobacteriun tuberculosis. Existen varias formas de la infección cutánea, siendo el lupus vulgar la más frecuente y común en los países industrializados. Las variantes clínicas dependerán de la vía de llegada del bacilo a la piel, del estado inmunológico del paciente y del medio ambiente. En el lupus vulgar, además de M. tuberculosis puede estar implicado M. bovis y menos frecuentemente el bacilo de Calmette y Guérin. Esta entidad presenta una evolución crónica, es de carácter progresivo y es rara de ver en niños. Se presenta el caso de una niña en la cual se diagnosticó una forma de tuberculosis cutánea denominada lupus vulgar provocada por el bacilo de Calmette y Guérin. Caso clínico: niña de 10 años que presentaba lesiones cutáneas de diferentes características, de evolución tórpida y asintomáticas; la de mayor tamaño se localizaba en la cara externa del deltoides derecho en forma de placa eritematosa de 20 por 10 cm con bordes sobreelevados presentando en su centro micropápulas que coalescen dejando una zona de atrofia central. Esta había comenzado en etapa neonatal luego de la vacunación por el bacilo de Calmette y Guérin. Desde hacía tres años presentaba una segunda lesión más pequeña en cara externa de muslo derecho de similares características y otras de carácter múltiple en dorso con forma de micropápulas rojo vinosas. Los exámenes de valoración general fueron normales, al igual que la radiografía de tórax y de los miembros. El test de la tuberculina mostró una induración de 15 mm y las baciloscopias fueron negativas. La biopsia de la lesión de piel del deltoides mostró granulomas caseosos y las técnicas moleculares diagnosticaron Mycobacterium bovis atenuado. Con ese diagnóstico, recibió tratamiento antituberculoso por diez meses con buena tolerancia y con mejoría de las lesiones.

Cutaneous TB is a rather unusual chronic infectious disease caused by Mycobacteriun tuberculosis. There are several forms of cutaneous infection, lupus vulgaris being the most frequent and ordinary one in developed countries. Clinical variations will depend on the site of infiltration of the skin by the bacillus, the patient's immune condition and the environment. In the case of lupus vulgaris, apart from Mycobacteriun tuberculosis, M. bovis may be involved, and the Bacille Calmette Guérin involvement is less frequent. The latter presents a chronic evolution, being progressive and unusual in children. The study presents the case of a girl who was diagnosed with a form of cutaneous tuberculosis called lupus vulgaris caused by the Bacille Calmette-Guérin vaccine. Clinical case: a 10 year old girl who evidenced skin lesions of different kinds, of slow evolution and asymptomatic: the largest one was in the external part of the right deltoid muscle as an erythematous plaque of 20 by 10 cm with higher borders evidencing micro papules in the center that coalesce leaving a central atrophy zone. The latter had started in the neonatal stage after the Bacille Calmette-Guérin vaccine. For three years she had evidenced a second smaller lesion in the outer face of the right thigh of similar characteristics and other multiple lesions in the back with the shape of vinous red micro papules. Assessment tests were generally normal, as well as the chest and limbs X-ray. The tuberculin test evidenced a 15 mm induration and smears were negative. The deltoid muscle skin lesion biopsy showed caseous granulomas and molecular techniques diagnosed attenuated Mycobacteriumbovis. Given that diagnose the patient received anti-TB treatment during 10 months, tolerance being good and the lesions improved.

A tuberculose cutânea é uma doença infecciosa crônica e pouco frequente causada pelo Mycobacteriun tuberculosis. Existem várias formas de infecção cutânea, sendo o lúpus vulgar a mais frequente e comum nos países industrializados. As variantes clínicas dependerão da via de entrada do bacilo à pele, do estado imunológico do paciente e do ambiente. No lúpus vulgar, além do M. tuberculosis podem estar implicados o M. bovis e mais raramente o bacilo de Calmette-Guérin. Esta entidade apresenta uma evolução crônica, é progressiva e é rara em crianças. Apresenta-se o caso de uma paciente de sexo feminino com 10 anos que foi diagnosticada com uma forma de tuberculose cutânea denominada lúpus vulgar provocada pelo bacilo de Calmette-Guérin. Caso clínico: paciente de sexo feminino com 10 anos que apresentava lesões cutâneas de diferentes características, com evolução letárgica e assintomática; a maior lesão estava localizada na face externa do deltoide direito sob a forma de placa eritematosa de 20 x 10 cm com bordes sobrelevados apresentando no centro micropápulas que coalescem deixando una zona de atrofia central. Esta lesão começou na etapa neonatal depois da vacinação com o bacilo de Calmette-Guérin. Desde 3 anos apresentava uma segunda lesão menor na face externa da coxa direita com características similares e outras múltiplas no dorso com forma de micropápulas com coloração de manchas em vinho do Porto. Os exames de avaliação geral foram normais, bem como as radiografias de tórax e de membros. O teste da tuberculina mostrou uma induración de 15 mm e as baciloscopias foram negativas. A biopsia da lesão de pele dos deltoides mostrou granulomas caseosos e as técnicas moleculares diagnosticaram Mycobacterium bovis atenuado. Com esse diagnóstico recebeu tratamento antituberculoso por 10 meses com boa tolerância e melhoria das lesões.

Whole-Genome Sequencing of an Isoniazid-Resistant Clinical Isolate of Mycobacterium tuberculosis Strain MtURU-002 from Uruguay.

The incidence of tuberculosis in Uruguay has been effectively reduced to <30 per 100,000 population, although an increase in nonrisk populations in the last few years is evident. Here, we present the genome sequence of Mycobacterium tuberculosis strain MtURU-002 isolated from a patient showing bilateral pulmonary tuberculosis that was resistant to isoniazid.

Complete Genome Sequence of Mycobacterium tuberculosis Strain MtURU-001, Isolated from a Rapidly Progressing Outbreak in Uruguay.

Despite efficient control programs, large clonal outbreaks of tuberculosis (TB) may arise in low-risk populations. Recently, an unusual TB outbreak was reported in Uruguay, reaching an elevated disease attack rate (53 to 69%). Here, we report the genome sequence of the Mycobacterium tuberculosis strain associated with this rapidly progressing outbreak, named MtURU-001.

Primeros casos de tuberculosis pulmonarpor Mycobacterium bovis: una zoonosis reemergente en Uruguay / First cases of pulmonary tuberculosis caused by Mycobacterium bovis: a re-emerging zoonosis in Uruguay

Se describen los primeros tres casos de tuberculosis pulmonar por Mycobacterium bovis en Uruguay. Uno de los enfermos poseía antecedentes de contacto con animales en un zoológico; el otro, portador del virus de inmunodeficiencia humana (VIH), estaba en contacto cotidiano con derivados cárnicos de ganado vacuno, el tercero poseía antecedentes deingestión de leche no pasteurizada. En todos los casos se pudo confirmar la etiología mediante la aplicación rutinaria de técnicas de biología molecular en conjunto con la bacteriologíaconvencional. A pesar de que se ha realizado la búsqueda sistemática de M. bovis en muestras clínicas que ingresan a nuestro laboratorio, hasta ahora no se habían podido reportar aislamientos de origen humano. La presencia de este microorganismo en muestras veterinarias en la última décadapermite esperar la aparición de nuevos casos en sujetos inmunocompetentesy pacientes VIH/SIDA. El antecedente decontacto estrecho con animales, especialmente ganado bovino, o con sus productos derivados, o ambos, debe alertar al clínico sobre la posibilidad de esta zoonosis en cuyo tratamiento se debe excluir la pirazinamida.

The study describes the first three cases of pulmonary tuberculosis caused by Mycobacterium bovis in Uruguay.One of the infected people had a history of being in contact with zoo animals, another one, an HIV carrier, was in daily contact with meat by-products, andthe third one had a history of drinking unpasteurized milk. Molecular biology techniques and conventional bacteriology enabled the confirmation of the etiology in all cases. In spite of the systematic search for M. bovis in the clinical samples analysed in our laboratories, no isolation of Mycobacterium bovis from human caseshad been reported until then. The presence of this microorganism in our veterinary samples during the lastdecade indicates we may continue to see new cases in immune competent people and HIV/AIDS patients. A history of close contact with animals, particularly bovines, with meat by-products, or both should warn clinicians about the possibility of this zoonosis, whose treatment should exclude pyrazinamide.

Os três primeiros casos de tuberculose pulmonar por Mycobacterium bovis no Uruguai são descritos.Umdos pacientes apresentava antecedentes de contacto com animais em um zoológico; o outro, portador de VIH, estava em contacto cotidiano com derivados de carne degado bovino e o terceiro tinha antecedentes de ingestão de leite não pasteurizada. Foi possível confirmar a etiologia em todos os casos pela utilização de rotina de técnicas de biologia molecular juntamente com bacteriologia convencional. Apesar de que se realiza pesquisa sistemáticade M. bovis nas amostras clínicas que chegam ao nosso laboratório, até esta oportunidade não havia sido possível registrar isolamentos de origem humano.A presença deste micro-organismo em amostras veterinárias na última década permite esperar o surgimento denovos casos em pessoas imunocompetentes e pacientes VIH/SIDA. O antecedente de contacto próximo com animais, especialmente gado bovino, ou com seus derivados, ou ambos, deve alertar o clínico sobre apossibilidade da presença desta zoonose em cujo tratamento a pirazinamida deve ser excluída.

Prevalence and dissemination of the Ser315Thr substitution within the KatG enzyme in isoniazid-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis isolated in Uruguay.

The aim of this study was to determine the prevalence of Ser315Thr substitution in isoniazid (INH)-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis in Uruguay. The katG gene of 62 INH-resistant strains was analysed by an RFLP-PCR assay. PCR products were digested with MspI to detect Ser315Thr and Arg463Leu substitutions. A total of 16 of the 62 (26 %) INH-resistant strains analysed had a Ser315Thr substitution. Only one INH-resistant strain had an Arg463Leu substitution and two strains had a deletion in katG. Of the 16 strains with Ser315Thr, 15 showed different profiles using a double-repetitive-element PCR assay, demonstrating that there was no local dissemination of any particular strain. These findings are in agreement with published data from regions where the prevalence of tuberculosis (TB) is intermediate and may be due in part to the success of the local TB control programme.

Utilidad de la dosificación de adenosin deaminasa en el diagnóstico de la tuberculosis pleural: primera experiencia nacional / Utility of Adenosine Deaminase for the Differential Diagnosis of Pleural Tuberculosis. First National Experience

Introducción: la bacteriología del líquido pleural (LP) para el diagnóstico de la tuberculosis pleural (TBP) es lenta y poco sensible; la biopsia de mejor rendimiento es cruenta y costosa. A pesar de que la dosificación de la adenosin deaminasa (ADA) en el LP se describe como un recurso valioso para el diagnóstico de tuberculosis pleural no existe experiencia en nuestro medio. Objetivo: validar el uso de la dosificación de ADA en líquido pleural para diagnóstico de TBP. Material y método: dosificación de ADA por técnica colorimétrica de Giusti en 113 líquidos pleurales provenientes de 66 pacientes sospechosos de TBP (grupo gTBP) con bacteriología realizada y 47 pacientes con derrames de causa no tuberculosa, (grupo control gC). El valor de corte se estableció en 40 U/l. Resultados: en el grupo gTBP 12 pacientes presentaron ADA mayor a 40 U/l; en ocho se realizó diagnóstico TBP. Para el valor de corte establecido la ADA presentó una sensibilidad de 100 por ciento; especificidad de 93 por ciento; valor predictivo positivo (VPP): 67 por ciento; valor predictivo negativo (VPN): 100 por ciento. En el gC (n = 47) cuatro muestras presentaron valores de ADA mayores a 40 U/l (un timoma, un linfoma y dos empiemas). Conclusiones: la ADA en LP es una técnica sensible y específica para la TBP, destacándose su alto VPPN; reduce la necesidad de biopsias y acorta el tiempo diagnóstico; es de fácil ejecución y bajo costo. Existen otras enfermedades que elevan la ADA en el LP que deben considerarse en la interpretación de resultados.